在职研究生在职研究生双证和单证的主要区别体现在以下几个方面：
一、证书类型
双证在职研究生：学员毕业后可获得院校颁发的硕士学位和硕士学历双证，即学历证和硕士学位证。
单证在职研究生：学员课程结业，申硕成功后可获得院校颁发的硕士学位单证，即只有硕士学位证，没有学历证。
二、报考条件
双证在职研究生：报考条件与专业类别有关。非管理类专业一般要求考生大学本科毕业，或大专毕业满2年及以上，或已获硕士、博士学位。管理类专业则要求考生本科毕业工作3年以上，或大专毕业工作5年以上，或获得硕士、博士学位并工作2年以上。
单证在职研究生：分为课程班和申硕两部分。课程班一般要求报名人员拥有大专毕业及以上学历；申硕则要求申请人员拥有学士学位满三年或已获硕士、博士学位。
三、入学方式
双证在职研究生：需要先考试，后入学。考生需依次通过全国联考和院校复试，再由院校择优录取入学。考试难度较大，通过率不太高。
单证在职研究生：免试入学，先学后考。学员可以先参加课程学习，课程结业符合条件者可申硕，需要参加申硕全国统考，考试科目少，分数线固定，且学员可多次参加考试，通过率较高。
四、报考流程
双证在职研究生：每年9到10月登录院校库进行报名，11月现场确认信息，12月参加全国联考，通过后于次年3-4月参加复试，两次考试均通过的考生由院校择优录取。
单证在职研究生：课程班免试入学，课程结业后，可登录学位网进行申硕全国统考报名，报名时间一般在每年3月中到下旬，考试时间在5月下旬。
五、上课方式
双证在职研究生：主要上课方式有周末班、集中班，均为面授方式。
单证在职研究生：主要上课方式有面授的周末班、集中班，和在线学习的网络班。
六、学费
双证在职研究生：课程学费区间较大，为1.8万元-86.8万元，这与招生专业涵盖一些管理类专业有关。
单证在职研究生：课程学费区间为0.8万元-6万元，相对较为经济。
综上所述，在职研究生双证和单证在证书类型、报考条件、入学方式、报考流程、上课方式及学费等方面均存在显著差异。学员可根据自身实际情况和需求，选择适合的报考方式。
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