首先，培养方向不同
学术型硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位;专业型硕士是国家为了克服学术型硕士的不足新增的一种新硕士，培养的是现在市场紧缺的应用型人才。
其次，招生条件不同
学术型硕士则不需要报考者有一定年限的工作经历。国家09年新增的一月份统考的全日制专业型硕士并不要求工作经验，招生条件跟原来的学术型硕士一样，应届生可以报考。
第三，招生考试不同
学术型硕士的招生考试只有年初的“统考”，而统考以外的专业考试则由各招生单位自行命题、阅卷。专业硕士的招生考试有10月份的“联考”和年初的“统考”两次机会，考生可以自行选择，而这两大国家级别的考试的专业考试，也由各招生单位自行命题、阅卷。GCT在职硕士是参加10月份的联考，全日制专业硕士跟原来全日制学术型硕士考试时间一样，都是每年一月份初试。
第四，入学难度不同
学术型硕士的全国硕士研究生入学统一考试(统考)完全是严进宽出的代表。据了解，一些名校热门专业的录取比例甚至为70：1。而一些二流学校的冷门专业却年年招不满。因此，入学难度取决于考生报考的学校和专业。专业硕士的招生考试有10月份的“联考”和年初的“统考”两次机会，考生可自行选择。这两大国家级别考试的专业考试，是由各招生单位自行命题、阅卷。不同专业的入学难度各不相同，热门专业相对难一些。此外，“联考”和“统考”的难度也不一样，由于“统考”考生远多于“联考”考生，考试竞争激烈程度自然也大。不过，“联考”的考试虽容易，但录取时更看重申请者的工作背景和经验。
在职研究生学历和学位哪个更重要?
学历就是你在哪所学校学习的经历，体现就是毕业证，是学校发的。学位是你所取得的什么专业的资质证明，比如学士（本科），硕士（研究生），博士等，是国家教育部学位委员会发的。在职研究生和研究生有些区别，最主要的就是证书，在职研究生是非学历教育，只有一月统考能获得研究生学历证书和学位证书，除此之外其他任何专业都只能获得研究生硕士学位证书，不会涉及到学历问题。
因为通过在职研究生报考获得学位，也只能表明其在学术上已达到硕士学位的学术水平，具有硕士学位毕业研究生的同等学力(学习能力的“力”)，不涉及学历，所以申请人的学历不发生任何改变，但是对于就有更高层次的学术研究能力的硕士教育来说，学位可能比学历更有说服力。
虽然在职研究生没有学历证书，只有硕士学位证书，但是硕士学位证书的效力和统招研究生是一样的，考生可以继续考博士、出国留学、升职加薪、评职称等。
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