本科学历编制教师和硕士学位编制教师的区别，主要表现在以下几个方面：
1、入职门槛有区别。本科毕业生报考编制教师，目前在多数地方规定必须参加笔试和面试，包括说课、讲课等环节。硕士研究生毕业报考编制教师，有不少地方免笔试，仅参加面试，录用的概率大增。因此，硕士生参加教师招聘，比本科生有更大优势。
2、起薪待遇有区别。本科学历的编制教师，定级工资在元左右，硕士学位的编制教师则要高出一个级别，大约元左右。知识水平的高低所体现的价值是不同的。
3、晋升职称的资格条件有区别。如在有些地区，本科学历的编制教师，入职可直接认定为初级职称，教龄满五年后才能申报中级职称，再任职10年后才能申报高级职称。硕士在编教师虽然入职也直接认定为初级职称，但任职三年即可申报中级职称，中级任职7年以上，即可申报高级职称。职称一旦有岗位聘任，便与工资待遇挂钩，中级和高级差距较大。
总之，硕士生尽管比本科生多上了一至三年学，但从就业、工资待遇和长远利益上看，还是值得的。